据菲律宾《星报》2016年9月21日报道，此前曾表示美国特种部队“必须离开”的菲律宾总统杜特尔特再次调整立场，声称为了菲律宾在南海问题上的“利益”，当前暂不会要求美军从菲律宾撤出。
　　
　　9月20日，在对菲律宾第10步兵师发表讲话时，杜特尔特说：“我从未说过（要让美国人）现在就离开菲律宾，因为不管怎样，我们在南海问题上需要他们。”
　　
　　就在一周多以前，杜特尔特公开表示，美国的特种部队“必须离开”菲律宾南部棉兰老岛地区，因为美军士兵有可能成为被当地极端武装组织绑架的目标，而后者则可能以此谋取赎金。此番表态曾被广泛解读为杜特尔特对美军下达的“逐客令”。
　　
　　但在9月20日的讲话中，杜特尔特又声称，以菲律宾目前的装备和实力，无法与中国进行军事对抗。他还抱怨道，尽管菲律宾已经拥有了一批战斗机，但由于美国拒绝向菲律宾出售适合战斗机装备的导弹，因此这些飞机根本无法发挥战斗力。
　　
　　“问题在于他们（指美国）不想给我们导弹……因为没有导弹，我们的战斗机无法使用，完全成了摆设，我搞不懂这些美国人是怎么想的，在他们眼里我们好像低人一头。”他说。
　　
　　上海社会科学院国际问题研究所研究员李开盛此前对澎湃新闻表示：“美国和菲律宾的军事合作主要在5个军事基地、联合军演和反恐合作三个层面。而棉兰老岛的特种部队是协助反恐，事实上美军基地才具有指标性的意义。”
　　
　　李开盛在给澎湃新闻的撰文中写道，杜特尔特要做的就是从阿基诺三世时期的向美国“一边倒”到拉开适当距离。这种距离不但将给菲律宾更大的外交空间，同时势必也会加大美国的危机感，甚至迫使美国开出更好的条件来“留”住菲律宾。
　　
　　2014年，马尼拉和华盛顿签署了加强防务合作协议。按照这项协议，美军可以用轮调的方式出入菲律宾，并且可以修建或运营军事设施。协议签署后，菲律宾国内的民族主义者一直针对这一协议进行抗议。
　　
　　最近的抗议发生在9月16日，据台湾地区的“中国时报”报道，当天约100名抗议者聚集在美国驻菲律宾大使馆外，打出“美国是头号恐怖分子”“停止强奸我们的国家”等标语，抗议持续了数个小时。